RNA-Seq解析を利用してみよう

理研ジェネシスでは、RNA-Seq解析サービスを提供しています。

遺伝子発現レベルやスプライシングパターンによる解析を実施しており、生体内にある遺伝子発現変動について網羅的に解析することが可能です。

特異的な遺伝子発現パターンの同定を実現することができ、パスウェイとGO解析によって実用的な結果を得ることができます。

がんの原因になる融合遺伝子を探索することが可能です。

解析概要について、次世代シーケンサーよって全転写物の塩基配列を決めることができます。

リード配列を参照配列にしてマッピングしていき、転写物のアセンブリングや発現レベルの算出を実現することが可能です。

複数のサンプルの場合、サンプル間による発現レベルを比較しています。

目的やRNAの品質などに対応して、適切な方法を選択することができるでしょう。

オプションではバイオインフォマティクス解析があり、融合遺伝子探索（ヒトのみ対応可能）ではペアエンドリード配列によって、融合遺伝子を探索しています。

ソフトウェアを併用しながら、融合遺伝子の検出力を向上することが可能です。

指定した遺伝子リストを基にして、階層型クラスタリングを実施したり、ヒートマップの作図を行うことができます。

パスウェイ解析はヒト・マウスやラットに対応していて、最新KEGGデータベースを基にしながらパスウェイ解析を利用可能です。

独自の手法によって、高精度な結果を得ることができるでしょう。